MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.05

Total Repeats: 659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019741	AGT	2	6	241	246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314671
2	NC_019741	GGTA	2	8	277	284	25 %	25 %	50 %	0 %	428314671
3	NC_019741	CAA	2	6	311	316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314671
4	NC_019741	GGT	2	6	367	372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314671
5	NC_019741	GGGA	2	8	382	389	25 %	0 %	75 %	0 %	428314671
6	NC_019741	AGGACA	2	12	429	440	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428314671
7	NC_019741	TTCC	2	8	856	863	0 %	50 %	0 %	50 %	428314672
8	NC_019741	GTT	2	6	874	879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314672
9	NC_019741	TCGC	2	8	968	975	0 %	25 %	25 %	50 %	428314672
10	NC_019741	CTGC	2	8	1029	1036	0 %	25 %	25 %	50 %	428314672
11	NC_019741	CTC	2	6	1044	1049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314672
12	NC_019741	TCT	2	6	1065	1070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314672
13	NC_019741	GTG	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314672
14	NC_019741	AGT	2	6	1333	1338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314672
15	NC_019741	CAA	2	6	1339	1344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314672
16	NC_019741	CCA	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314672
17	NC_019741	TGA	2	6	1379	1384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314672
18	NC_019741	CCA	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314672
19	NC_019741	GAC	2	6	1397	1402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314672
20	NC_019741	CT	3	6	1410	1415	0 %	50 %	0 %	50 %	428314672
21	NC_019741	TCA	2	6	1420	1425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314672
22	NC_019741	ACC	2	6	1485	1490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314672
23	NC_019741	T	7	7	1520	1526	0 %	100 %	0 %	0 %	428314672
24	NC_019741	T	7	7	1581	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	428314672
25	NC_019741	GCG	2	6	1588	1593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314672
26	NC_019741	CAA	2	6	1654	1659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314672
27	NC_019741	CATC	2	8	1714	1721	25 %	25 %	0 %	50 %	428314672
28	NC_019741	GCA	2	6	1747	1752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314672
29	NC_019741	CGG	2	6	1780	1785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314672
30	NC_019741	TGC	3	9	1806	1814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314672
31	NC_019741	GATA	2	8	1816	1823	50 %	25 %	25 %	0 %	428314672
32	NC_019741	CGA	2	6	1915	1920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314672
33	NC_019741	TGG	2	6	1930	1935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314672
34	NC_019741	CAG	2	6	1952	1957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314672
35	NC_019741	AGGA	2	8	2040	2047	50 %	0 %	50 %	0 %	428314672
36	NC_019741	GCGG	2	8	2117	2124	0 %	0 %	75 %	25 %	428314672
37	NC_019741	GCG	2	6	2142	2147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314672
38	NC_019741	CTGTT	2	10	2276	2285	0 %	60 %	20 %	20 %	428314672
39	NC_019741	CTG	2	6	2357	2362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314672
40	NC_019741	TTG	2	6	2363	2368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314672
41	NC_019741	GTTCA	2	10	2399	2408	20 %	40 %	20 %	20 %	428314672
42	NC_019741	CT	3	6	2419	2424	0 %	50 %	0 %	50 %	428314672
43	NC_019741	TGC	2	6	2434	2439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314672
44	NC_019741	TCA	2	6	2470	2475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314672
45	NC_019741	CCT	2	6	2500	2505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314672
46	NC_019741	AG	3	6	2531	2536	50 %	0 %	50 %	0 %	428314672
47	NC_019741	GAG	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314672
48	NC_019741	TCA	2	6	2709	2714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314672
49	NC_019741	ATG	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314672
50	NC_019741	AG	3	6	2801	2806	50 %	0 %	50 %	0 %	428314672
51	NC_019741	AAC	2	6	2811	2816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314672
52	NC_019741	TTC	2	6	2915	2920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314672
53	NC_019741	T	6	6	2985	2990	0 %	100 %	0 %	0 %	428314672
54	NC_019741	CTAG	2	8	3012	3019	25 %	25 %	25 %	25 %	428314672
55	NC_019741	AGTG	2	8	3041	3048	25 %	25 %	50 %	0 %	428314672
56	NC_019741	ATA	2	6	3311	3316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314673
57	NC_019741	TGTT	2	8	3317	3324	0 %	75 %	25 %	0 %	428314673
58	NC_019741	ATT	2	6	3380	3385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314673
59	NC_019741	ATA	2	6	3413	3418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314673
60	NC_019741	GCCA	2	8	3561	3568	25 %	0 %	25 %	50 %	428314673
61	NC_019741	TGT	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314673
62	NC_019741	CA	3	6	3661	3666	50 %	0 %	0 %	50 %	428314673
63	NC_019741	CTG	2	6	3685	3690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314673
64	NC_019741	TCG	2	6	3747	3752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314673
65	NC_019741	TGAG	2	8	3771	3778	25 %	25 %	50 %	0 %	428314673
66	NC_019741	AGC	2	6	3813	3818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314673
67	NC_019741	AGC	2	6	3863	3868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314673
68	NC_019741	CAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314673
69	NC_019741	TCA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314673
70	NC_019741	TGC	2	6	3976	3981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314673
71	NC_019741	TCC	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314673
72	NC_019741	GGC	2	6	4470	4475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314674
73	NC_019741	T	6	6	4585	4590	0 %	100 %	0 %	0 %	428314674
74	NC_019741	CCG	2	6	4615	4620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314674
75	NC_019741	CAA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314674
76	NC_019741	TC	3	6	4689	4694	0 %	50 %	0 %	50 %	428314674
77	NC_019741	CT	3	6	4760	4765	0 %	50 %	0 %	50 %	428314674
78	NC_019741	TGCCAG	2	12	4959	4970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428314674
79	NC_019741	TGC	2	6	5016	5021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314674
80	NC_019741	AGC	2	6	5545	5550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314675
81	NC_019741	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314675
82	NC_019741	CTT	2	6	5632	5637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314675
83	NC_019741	CTT	2	6	5759	5764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314675
84	NC_019741	TGT	2	6	5836	5841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314675
85	NC_019741	GCG	2	6	5861	5866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314675
86	NC_019741	G	6	6	5899	5904	0 %	0 %	100 %	0 %	428314675
87	NC_019741	GCT	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314675
88	NC_019741	ACT	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314675
89	NC_019741	AAG	2	6	6022	6027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314675
90	NC_019741	ATC	2	6	6092	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314675
91	NC_019741	ACAT	2	8	6141	6148	50 %	25 %	0 %	25 %	428314675
92	NC_019741	ATT	2	6	6211	6216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314675
93	NC_019741	ATT	2	6	6223	6228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314675
94	NC_019741	CAG	2	6	6237	6242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314675
95	NC_019741	GTA	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314676
96	NC_019741	ATCT	2	8	6490	6497	25 %	50 %	0 %	25 %	428314676
97	NC_019741	CA	3	6	6539	6544	50 %	0 %	0 %	50 %	428314676
98	NC_019741	CG	3	6	6566	6571	0 %	0 %	50 %	50 %	428314676
99	NC_019741	ACC	2	6	6579	6584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314676
100	NC_019741	TG	3	6	6596	6601	0 %	50 %	50 %	0 %	428314676
101	NC_019741	ATG	2	6	6629	6634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314676
102	NC_019741	CTG	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314676
103	NC_019741	GTC	2	6	6691	6696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314676
104	NC_019741	CGC	2	6	6772	6777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314676
105	NC_019741	ATC	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314676
106	NC_019741	GGC	2	6	6814	6819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314676
107	NC_019741	GCC	2	6	6919	6924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314676
108	NC_019741	TGA	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314676
109	NC_019741	CCG	2	6	6969	6974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314676
110	NC_019741	CGC	2	6	6995	7000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314676
111	NC_019741	GTTG	2	8	7036	7043	0 %	50 %	50 %	0 %	428314676
112	NC_019741	TGAT	2	8	7049	7056	25 %	50 %	25 %	0 %	428314676
113	NC_019741	CTA	2	6	7071	7076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314676
114	NC_019741	CGG	2	6	7077	7082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314676
115	NC_019741	ACT	2	6	7133	7138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314676
116	NC_019741	GGC	2	6	7166	7171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314676
117	NC_019741	CA	3	6	7218	7223	50 %	0 %	0 %	50 %	428314676
118	NC_019741	CGA	2	6	7347	7352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314676
119	NC_019741	CTG	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314676
120	NC_019741	CGA	2	6	7431	7436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314676
121	NC_019741	CGA	2	6	7469	7474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314676
122	NC_019741	GAG	2	6	7549	7554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314676
123	NC_019741	CT	3	6	7578	7583	0 %	50 %	0 %	50 %	428314676
124	NC_019741	CACAC	2	10	7632	7641	40 %	0 %	0 %	60 %	428314676
125	NC_019741	CCAG	2	8	7827	7834	25 %	0 %	25 %	50 %	428314676
126	NC_019741	GCG	2	6	7878	7883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314676
127	NC_019741	GTG	2	6	7899	7904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314676
128	NC_019741	TCT	2	6	7910	7915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314676
129	NC_019741	TCG	2	6	7923	7928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314676
130	NC_019741	ATC	2	6	7976	7981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314676
131	NC_019741	CCG	2	6	8027	8032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314676
132	NC_019741	ATTTC	2	10	8153	8162	20 %	60 %	0 %	20 %	428314677
133	NC_019741	TGCT	2	8	8216	8223	0 %	50 %	25 %	25 %	428314677
134	NC_019741	CTT	2	6	8242	8247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314677
135	NC_019741	TAGCTG	2	12	8291	8302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428314677
136	NC_019741	CTG	2	6	8321	8326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314677
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139	NC_019741	TTG	2	6	8421	8426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314677
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142	NC_019741	TTG	2	6	8477	8482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314677
143	NC_019741	TTG	2	6	8517	8522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314677
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151	NC_019741	GATTC	2	10	8795	8804	20 %	40 %	20 %	20 %	428314678
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251	NC_019741	AAG	2	6	14790	14795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314684
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254	NC_019741	TAT	2	6	14895	14900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314684
255	NC_019741	ATC	2	6	14924	14929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314684
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258	NC_019741	TGT	2	6	15095	15100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314684
259	NC_019741	T	6	6	15112	15117	0 %	100 %	0 %	0 %	428314684
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261	NC_019741	TCG	2	6	15227	15232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314684
262	NC_019741	TTGAC	2	10	15254	15263	20 %	40 %	20 %	20 %	428314684
263	NC_019741	ATG	2	6	15299	15304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314684
264	NC_019741	TCT	2	6	15317	15322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314684
265	NC_019741	GCC	2	6	15378	15383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314684
266	NC_019741	GAT	2	6	15385	15390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314684
267	NC_019741	GCC	2	6	15488	15493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314684
268	NC_019741	TCA	2	6	15581	15586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314684
269	NC_019741	GCG	2	6	15594	15599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314684
270	NC_019741	GCC	2	6	15814	15819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314684
271	NC_019741	TCA	2	6	15857	15862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314684
272	NC_019741	TTC	2	6	15971	15976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314684
273	NC_019741	CGC	2	6	16058	16063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314684
274	NC_019741	AG	3	6	16258	16263	50 %	0 %	50 %	0 %	428314684
275	NC_019741	CAGT	2	8	16274	16281	25 %	25 %	25 %	25 %	428314684
276	NC_019741	CAG	2	6	16345	16350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314684
277	NC_019741	CGCT	2	8	16379	16386	0 %	25 %	25 %	50 %	428314684
278	NC_019741	CAACT	2	10	16390	16399	40 %	20 %	0 %	40 %	428314684
279	NC_019741	GTA	2	6	16414	16419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314684
280	NC_019741	CGA	2	6	16437	16442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314684
281	NC_019741	CTGG	2	8	16447	16454	0 %	25 %	50 %	25 %	428314684
282	NC_019741	T	6	6	16524	16529	0 %	100 %	0 %	0 %	428314684
283	NC_019741	CAC	2	6	16608	16613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314684
284	NC_019741	CCA	2	6	16628	16633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314684
285	NC_019741	TG	3	6	16740	16745	0 %	50 %	50 %	0 %	428314684
286	NC_019741	T	6	6	16789	16794	0 %	100 %	0 %	0 %	428314684
287	NC_019741	GTC	2	6	16837	16842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314684
288	NC_019741	ATC	2	6	16861	16866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314684
289	NC_019741	ACCA	2	8	16888	16895	50 %	0 %	0 %	50 %	428314684
290	NC_019741	CCAA	2	8	16896	16903	50 %	0 %	0 %	50 %	428314684
291	NC_019741	TCG	2	6	16913	16918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314684
292	NC_019741	CTTT	2	8	17027	17034	0 %	75 %	0 %	25 %	428314684
293	NC_019741	TGGTGC	2	12	17059	17070	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428314684
294	NC_019741	G	6	6	17132	17137	0 %	0 %	100 %	0 %	428314684
295	NC_019741	CATC	2	8	17150	17157	25 %	25 %	0 %	50 %	428314684
296	NC_019741	CGT	2	6	17187	17192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314684
297	NC_019741	TGTT	2	8	17501	17508	0 %	75 %	25 %	0 %	428314684
298	NC_019741	TGA	2	6	17545	17550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314684
299	NC_019741	CCT	2	6	17940	17945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314685
300	NC_019741	CTT	2	6	17961	17966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314685
301	NC_019741	GCG	2	6	18023	18028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314685
302	NC_019741	GAT	2	6	18031	18036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314685
303	NC_019741	TGA	2	6	18075	18080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314685
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332	NC_019741	CGAG	2	8	20217	20224	25 %	0 %	50 %	25 %	428314689
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342	NC_019741	CAT	2	6	20872	20877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314692
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370	NC_019741	TGG	2	6	22373	22378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314696
371	NC_019741	T	6	6	22395	22400	0 %	100 %	0 %	0 %	428314696
372	NC_019741	ATTGGT	2	12	22419	22430	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428314696
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387	NC_019741	CAT	2	6	23436	23441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314697
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